Die Fährhafen Sassnitz GmbH und die Deutsche Eisenbahn Service AG betreiben gemeinsam das eigenständige öffentliche Eisenbahnverkehrsunternehmen Baltic Port Rail Mukran GmbH.
Das Unternehmen bietet unter anderem den Rangierbetrieb und die wagentechnische Untersuchung an. Der Hafen- und Schienenumschlag ist mit dem Hafen- und Eisenbahnbetrieb optimal verzahnt.